地球へ進路を向け、デラーズ・フリーとの星の屑作戦は着々と進んでいく。しかし、連邦と内通していたシーマが謀反を起こしてデラーズを人質に！動きの遅い連邦軍にもコロニー落としを防ぐための秘策が用意されていて･･･一方、ガトーとの戦いで現在の装備では勝てないと感じたコウは3号機の再調整をして出撃する。それぞれの思惑が絡み合う中でコロニー落としのカウントダウンが始まる！