2号機、3号機のテストを終え、基地に帰還したユウ。地上でのジオン掃討作戦が開始され、ユウ達モルモット隊はキャリフォルニア・ベース奪還作戦に参加することになる。ジオンの激しい抵抗を受けて苦戦する本隊を援護するため、ユウは新装備・1号機フルアームドで突破口を開く！しかし、そこにニムバスのイフリート改が現れて･･･ＥＸＡＭ機同士がついに激突する！