スラース独立派から仕掛けてきた大規模な攻撃はシンタたちの活躍もあって何とか撃退に成功する。新たな教官を迎え、再び訓練カリキュラムに戻るシンタたちであったがダズーからクリムゾン・クロウズと共同作戦の命令を受ける。その作戦内容とはシンタの父・リカードとダズーの師匠である「黒い糸」を救出することで･･･