ケイト達がエドワードら相手に奮闘している裏で暗躍していたアンソニーはクリストファー（2代目）を復活させ、こどもたちの前に現れる。コーヒーで洗脳させてこどもたちを大人たちと戦う兵士に育てようとこどもたちの棟は異様な雰囲気に。明かされるアンソニーの過去とシャドーハウス誕生の黒幕。一方、仲間を奪われたケイトにも少しずつ同志が集まっていく！