第一次ネオ・ジオン戦争が終結後のU.C.0091。火星に落ち延びたジオン残党の一部はアリシア・ザビ総帥の下、レジオンを結成。グリプス戦役で地球圏を離脱したティターンズ残党を吸収して独自の戦力を増強していた。地球侵攻に協力し、移民船団に付いて火星へ戻ってきたジオンマーズはレジオンに体制が取って代わられたのを知って攻撃を仕掛けるが･･･！？